Hoje eu tive que consertar uma tabela mysql onde uma coluna latin1 foi preenchida com dados codificados em utf8 .
O truque era converter os dados de volta para binário e convertê-los como utf8, para deixar que o mysql fosse codificado em utf8 e convertê-lo corretamente
update tableName
set fieldName = cast(convert(fieldName, binary) AS CHAR CHARACTER SET utf8);
Espero que ajude!