Você pode converter um VDI ou VMDK de tamanho dinâmico em um disco de tamanho fixo (e mais rápido) ao implantar sua VM usando as ferramentas do VirtualBox.
VBoxManage clonehd dynamic.vdi fixed.vdi --variant Fixed
… e se precisar redimensionar o disco, você pode usar:
VBoxManage modifyhd fixed.vdi --resize [megabytes]