Use Storm TickTuples para executar tarefas em intervalos fixos.

Configure o intervalo TickTuple como tal

Config conf = new Config();
conf.put(Config.TOPOLOGY_TICK_TUPLE_FREQ_SECS, 1);

Veja como saber se é uma tupla de tick

if(input.getSourceStreamId().equals("__tick")) {
    System.out.println("Got a tick tuple here!");
}