Para reverter o commit de mesclagem, você deve encontrar seu hash usando o git log.
git log --merges
dá a você apenas commits de mesclagem (tendo 2 pais).
Agora você pode reverter para um dos pais usando:
git revert -m 1 b413689
Onde 1 é o primeiro pai do commit de mesclagem – o branch com check-out e 2 o segundo pai do merge – o branch mesclado.
Você pode ver os dois commits pai usando:
git cat-file -p b413689
que fornece informações semelhantes a esta:
tree 98ddaeeda349fe5b8f8334a290237d990c67b498
parent b2180b93c6275841879a37fb11b90774e89cc9ad
parent c6378ad0621bf6ab946c526a2cf7b6b56d10a03a
author Michal Lipski <...> 1384528720 +0100
committer Michal Lipski <...> 1384528720 +0100
merge with feature/BM3329
Vendo os compromissos dos pais, você pode decidir qual deles reverter.