Substitua YOURDATABASENAME por algo um pouco mais relevante.
Para obter uma lista de todas as tabelas InnoDB:
SELECT TABLE_NAME AS name, ENGINE FROM information_schema.TABLES WHERE TABLES.table_schema = "YOURDATABASENAME" AND ENGINE = "InnoDB";
Para obter uma lista de todas as tabelas MyISAM:
SELECT TABLE_NAME AS name, ENGINE FROM information_schema.TABLES WHERE TABLES.table_schema = "YOURDATABASENAME" AND ENGINE = "MyISAM";