Projeto Yoeman construindo apenas no diretório raiz

Acabei de passar um bom tempo tentando entender por que, quando eu construo um novo projeto yoeman de dentro de uma subpasta do meu diretório principal, ele sempre irá para a raiz.

Parece que a causa desse problema se deve ao Gruntfile.js . Yoeman irá procurar por Gruntfile.js no diretório em que você está e se não estiver presente, ele irá até o diretório mais alto que puder ser encontrado, que no meu caso era o root! Em seguida, ele construirá seu projeto no mesmo diretório do arquivo Gruntfile.js .

Solução simples, crie seu diretório:
mkdir newapp && cd newapp

copie o arquivo do seu diretório raiz:
sudo cp -v Gruntfile.js newapp

e então inicie:
yeoman init

Eu espero que isso ajude