Edição da comunidade
A única solução que encontrei é compactar e copiar o /var/lib/neo4j-server/data/graph.dbdiretório.
$ tar -cvzf /tmp/neo4j-backup/2013-11-07-graph.gb.tar.gz /var/lib/neo4j-server/data/graph.db/Edição empresarial
Se você estiver usando a edição empresarial – você tem sorte. Basta usar a neo4j-backupferramenta. Suporta backups completos e incrementais. Veja a documentação para detalhes.
$ neo4j-backup -from single://192.168.1.34 -to /tmp/backup/neo4j-backupDepois disso, você pode mover o backup para outro servidor via ssh usando scp.