De acordo com a documentação, isso deve funcionar em uma compilação do Gradle:
tarefa packageJar (tipo: Jar) {
from sourceSets.main.classes
}
Mas se você executá-lo, provavelmente obterá um erro no Gradle 1.2.
Em vez disso, tente isto:
task packageJar (tipo: Jar) {
from sourceSets.main. saída
}
E tudo deve funcionar bem.