Ao instalar o MongoDB, você pode colocar a pasta bin no caminho para que possa iniciá-lo com mongod em qualquer lugar do terminal. Aqui eu coloco no final do meu arquivo ~ / .bashrc para que toda vez que eu abro meu terminal o mongod funcione.
export PATH="/home/cassio/mongodb/mongodb-linux-x86_64-2.4.9/bin:$PATH"