Isso vem da minha experiência com rails 3.1 / Capybara 2.03, mas talvez alguém ache isso útil:
Capybara ignora config, ru, portanto, qualquer mapeamento que você configurou lá será perdido para os testes, e você receberá erros de roteamento
Solução:
#spec_helper
Capybara.app = Rack::UrlMap.new('/subfolder' => Rails.application)