Primeiro, diga ao Vim qual extensão de arquivo você deseja definir como o tipo de arquivo markdown
autocmd BufRead,BufNewFile {*.markdown,*.mdown,*.mkdn,*.md,*.mkd,*.mdwn,*.mdtxt,*.mdtext,*.text} set filetype=markdown** Lista de extensão de arquivo Markdown popular de Superuser.com
Então, desative a sintaxe para markdown
autocmd FileType markdown setlocal syntax=off spell** spellé opcional se você deseja ativar o corretor ortográfico.
Aqui está um resultado:
