Então você configurou 3 janelas divididas e agora deseja fechar uma delas sem perder o posicionamento. O problema é que :bwna verdade exclui as janelas relacionadas ao buffer, como diz o doc: “Todas as janelas para este buffer estão fechadas”
Solução:
:ene | bw #Ou coloque a linha abaixo em seu .vimrc:
nmap <leader>c :ene<CR>:bw #<CR>E digite c