Se precisar de uma segunda instância de todo o seu ambiente de desenvolvimento no mesmo Mac, você encontrará um problema irritante com a Mac App Store .
Parece que a loja vê os aplicativos que você instalou na partição “antiga” e não permite que você instale novamente seus aplicativos no novo ambiente.
Como consertar isso? Você não pode . Mas há uma solução alternativa que funciona
desmonte temporariamente a outra partição antes de usar a Mac App Store
Erro corrigido. Vamos continuar…
(fonte: http://apple.stackexchange.com/questions/32069/mac-app-store-and-multiple-os-partitions )